元始天尊出手，将混元珠拆解为灵珠与魔丸，并且言称灵珠转世济世成仙，守护人间，魔丸则是被施加天劫咒，三年后将会被天雷毁灭。

天尊命太乙真人将灵珠护送到陈塘关，投胎陈塘关李靖尚未出生的孩子身上，但申公豹因出身妖族，常年不受仙界重视，心生嫉恨，暗中偷换灵珠魔丸。

最终，魔丸投胎李靖夫人殷夫人腹中，灵珠则落入东海龙族，转世为龙王三太子敖丙。

殷夫人怀胎三年零六个月诞下哪吒，他天生魔气缠身，力量狂暴，降生之初便险些作乱。

陈塘关百姓目睹其异相，个个都心生畏惧，将他认定为祸世妖魔，对其极尽排斥与偏见。

哪吒从出生起就没有其他同伴，受尽冷眼与孤立，满心渴望被世人接纳，却屡屡遭受驱赶和误解。

长久的孤独与偏见，让哪吒养成叛逆顽劣的性格，整日恶作剧捣乱，惊扰乡邻，用桀骜的外表掩饰内心的委屈与孤独。

李靖夫妇始终深爱哪吒，从来没有因为他是魔丸出身舍弃哪吒，并且为了约束哪吒的魔性，教他修身正道，太乙真人收他为徒，把火尖枪，混天绫，风火轮赐给了哪吒。

太乙真人以山河社稷图为幻境，让哪吒潜心修行法术，期间还捣鼓出了不少的笑料。

与此同时，李靖得知哪吒三年后将遭遇天劫的宿命，四处奔走，苦苦寻求破解之法，甚至求来了换命符，决心用自己的性命替哪吒挡劫，只为让儿子安然度过短暂一生。

修行之余，哪吒也一心想证明自己并非妖魔。

一次偶遇海妖掳走孩童，他奋力追妖救人，途中与灵珠转世的敖丙相遇交手。两人实力相当，境遇相似。

哪吒生来被世人唾弃，敖丙身为龙族后裔，背负着整个龙族的千年枷锁，龙族世代镇守海底炼狱，永世不得登天，全族将翻身的唯一希望寄托于敖丙，期盼着他能够以灵珠身份建功于天庭，解救族人。

同为孤独宿命的少年，二人摒弃立场对立，惺惺相惜，在海边相伴嬉戏，互相引为彼此唯一的知己，可这份情谊，终究被宿命裹挟。

哪吒三岁生辰宴如期而至，这也是天劫降临之日。

申公豹刻意到场，当众揭露灵珠，魔丸被调换的真相，告知哪吒注定天诛的宿命。

得知一切的哪吒，多年积压的委屈不甘与愤怒彻底爆发，魔性彻底失控，魔气席卷全场。

与此同时，敖丙陷入两难抉择，一边是唯一的知己，一边是全族千年的苦难与期盼。

最终，背负族人命运的敖丙选择妥协，卷起滔天海水化成一座冰山，想要直接以此冰封陈塘关，覆灭全城，以此斩断因果，换取龙族生机。